（一）主要职责

　　负责生态环境科技发展和基础能力建设。承担生态环境领域固定资产投资和项目管理相关工作，承担机关和直属单位预算、财务、基本建设、国有资产管理、政府采购、内部审计和规范津补贴工作，承担生态环境部参与分配的中央财政专项资金项目监督检查工作。承担生态环境科技工作，协调和组织实施重大生态环境科技计划项目。组织管理生态环境科技成果和科普工作。指导直属单位科技工作。承担生态环境领域科技体制改革。拟订和组织实施部级重点实验室和工程技术中心、科学观测研究站等建设规划。推动国家生态环境技术管理体系和重大技术工程示范。参与指导和推动绿色采购、清洁生产、循环经济、生态环保产业发展、生态保护补偿。

　　（二）内设机构

　　根据上述职责，内设5个机构。

　　1.综合处。承担司内文电等综合性事务和综合协调，承担扶贫、对口支援等工作。

　　2.科技发展处（简称科技处）。承担生态环境科技项目、科技成果、科技体制改革、科普、重点实验室及科学观测站建设等工作。

　　3.预算与财务资产处（简称预算处）。承担预算、中央本级能力建设项目、国库集中支付、非税收入、财务、固定资产、政府采购、银行账户、津补贴管理和住房制度改革工作。

　　4.投资与技术指导处（简称投资处）。承担国家重大生态环境保护项目、能力建设项目（不含中央本级）、基本建设项目管理，承担技术工程示范、工程技术中心建设、绿色采购、清洁生产、循环经济、生态环保产业发展、环境标志管理，以及生态保护补偿相关工作。

　　5.审计与项目监督办公室（简称审计室）。承担内部审计和中央财政专项资金项目监督检查工作。